治理河道与湿地外连接河道水质形成明显的差别，生态拦污工程治理水域内侧（生态拦污工程治理河段水域向三垟湿地河网内延50米）水质较治理外侧水域（生态拦污工程治理河段水域向三垟湿地河网外延50米）水质主要指标氨氮平均降低39.03%，总磷平均降低61.07%，高锰酸盐指数平均降低41.24%。符合合同要求的降低20%以上。
治理区域水质施工前后对比：
氨氮含量比施工前平均下67.73%，高锰酸盐指数比施工前平均下降58.52%以上，符合合同要求的降低20%以上。溶解氧含量平均值由施工前的1.57mg/L提升至4.01mg/L，平均提高160.65%，符合合同要求的提高20%以上。